>>732
目から鱗。こうか？
<target name="nkf">
　<native2Ascii encoding="EUC_JP" src="srcdir" dest="temp" includes="**/*.java"/>
　<native2Ascii encoding="UTF-8" src="temp" dest="destdir" includes="**/*.java" reverse="true"/>
</target>

俺も「Antでできないか」と思ったが、俺の場合はnkfタスク探してしまった。