Message Passing Interface (MPI) 統合スレ
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0001デフォルトの名無しさん
NGNGとりあえず本家
http://www-unix.mcs.anl.gov/mpi/
0385デフォルトの名無しさん
2009/10/26(月) 09:46:19高負荷のシングルスレッドを実行させると全CPUが12%程度になるよ(8core)。
LinuxでもたまにCPUを乗り換えるけどwindowsほど頻繁じゃない。
0386381
2009/10/26(月) 23:47:19実行したらどうなるんだろうと思った。
現在1〜8プロセスの全てのパターンをベンチ中。多分終わるのは明日。
> core i7か・・・いいな。このお金持ちめw いくらだった？
再利用などしたので、マザボとメモリとCPUしか買ってませんが、46,675円
> 1 thread あたりの作業量は ４つの時に比べて0.9*4/8=45%くらいの残念くんだった、って事？
そういう事です。
> CPU とプロセス（またはスレッド）のアフィニティはどうしてる？
そのあたり詳しくないのでほとんど設定変更せず使ってます。
ちなみにOpenMPI/CentOS5.4です。
0387デフォルトの名無しさん
2009/10/27(火) 16:27:05マルチ「スレッド」のプログラムならメモリ資源などの共用が多くHTの効果がでるかもしれないけど、
マルチ「プロセス」のMPIじゃ同一コアでキャッシュとメモリ帯域の争奪戦をするだけで効率低下すると思うけど。
0388デフォルトの名無しさん
2009/10/28(水) 02:43:340389デフォルトの名無しさん
2009/10/28(水) 02:57:18アフィニティで固定したとしても、論理コアが物理コアとリンクしているとは限らないだろうから、
コア間で依存性があった場合は注意が必要だと思う。
HTは簡単に言うと、あいているパイプラインを有効に使うことだから、2つの処理を同じコアで計算させていることだからね。
ただ、3次キャッシュが大きいので、コアが増えることでプリフェッチの恩恵は受けやすくなるかも。
0390デフォルトの名無しさん
2009/10/28(水) 02:59:50そりゃそうでしょ。MPIだってコアの指定をしないとだめ。
もちろんPthreadでも。
0391デフォルトの名無しさん
2009/10/28(水) 03:24:38383のを見るまで気づかんかったw
OpenMPだと dplace や taskset で固定できるけど、
これはハードベンダが作った奴だしねぇ。MPIで固定するのはどうするの(特にWin機)？
0392381
2009/10/28(水) 21:52:47悪禁になってしまったのだが結果だけかくと
5プロセスで走らせると最速のようです
0393デフォルトの名無しさん
2009/10/29(木) 01:33:12それだとメモリアクセスが一番のボトルネックじゃない？
ちょうど5コアでいい感じでメモリ帯域を食ってくれて、それ以下だと使い切れなくて、
それ以上だといっぱいになってしまう。
という感じに思える。
0394デフォルトの名無しさん
2009/10/29(木) 03:41:16最近はベクトル化を意識してループを短くして,(メモリでかくなったから)配列に中間結果を格納して・・・
というのがスパコンでは流行、というか推奨されるけど、HTでは
ループ内での処理が冗長なベクトル化をあまり意識してないw古いタイプの
コードが並列化では利得が大きいかも・・という事なのかな。
いまはCacheも大きいからたいがいループ内が長くても収まるし。
0395デフォルトの名無しさん
2009/12/04(金) 22:16:21使っているコンパイラー等はGfortran、open mpiです。解らなくなったのは、メインでBcastを使っても問題ないのですが、
サブルーチンでBcastを使うとエラーが発生してしまうんです。なんででしょうか？ちなみにプログラムは以下のとおりなんですが。
*
MPI 宣言文
*
IF(Nrank.EQ.0) NCP1=1000
CALL MPI_BCAST(NCP1,1,MPI_integer,0,MPI_COMM_WORLD,ierr)
*
KKK = 100
NNN = NCP1 + Nrank*KKK
PRINT *, NNN
これは問題なく動きますが、
IF（Nrank.eq.0) NCP1 = 1000
CALL MPI_BCAST(NCP1,1,MPI_integer,0,MPI_COMM_WORLD,ierr)
部分を IF(Nrank.EQ.0) CALL MAINSUBとし、サブルーチンを
SUBROUTINE MAINSUB
IMPLICIT REAL*8(A-H,O-Z)
COMMON /ACTIVE/ NCP1
*
NCP1 = 1000
CALL MPI_BCAST(NCP1,1,MPI_integer,0,MPI_COMM_WORLD,ierr)
*
RETURN
END
として、コンパイルし実行すると、 1000、 100、200、300と画面に出力され、notice thatjob rank 1 with PID 4737...の
メッセージが表示されますが、何故か原因が解らないのです。よろしくお願いします。
0396デフォルトの名無しさん
2009/12/04(金) 22:49:20サブルーチンMAINSUBの中でmpif.hのインクルードしてる？
0397デフォルトの名無しさん
2009/12/05(土) 07:53:230398デフォルトの名無しさん
2009/12/05(土) 08:04:520399デフォルトの名無しさん
2009/12/12(土) 13:25:37Windows XP+Vistal C++ 2008 Express以外に、どれをインストールすればよいのでしょうか？
0400デフォルトの名無しさん
2009/12/12(土) 23:30:240401デフォルトの名無しさん
2009/12/20(日) 02:28:58もしなかったら作ってみたいなっと思いまして．2ヶ月に一度くらい勉強会とかライトニングトークしあう的な規模のもので．
0402デフォルトの名無しさん
2009/12/20(日) 11:22:072ヶ月に一度とかタルいことしてたら、次の勉強会までにプログラムできるようになっている。
てか、それでできない人間だけ集まっても意味ないし、できる人間は参加してもタルいだけだろう。
0403デフォルトの名無しさん
2009/12/20(日) 11:52:25その一部以外を if(myrank==0) で囲えばいいの？
0404デフォルトの名無しさん
2009/12/20(日) 13:09:48非並列処理部分の結果を並列部分で使いたい時だったら
ちゃんと伝達するのを忘れないように＞＜
0405デフォルトの名無しさん
2009/12/21(月) 05:10:55なんとなく「プログラムのほとんどが if 文」ってのが違和感なんだけど
他に書き方ないよね
0406デフォルトの名無しさん
2009/12/21(月) 09:37:58並列の出入口でやることが決まっていれば関数に押し込めるけど、そういう事ってあまり多くないし
引数受渡し部分でちょんぼすることあるし・・・＞＜
0407デフォルトの名無しさん
2009/12/23(水) 09:49:25５００以下だと問題なく送受でき、送受結果を画面に表示できるのですが、５００個を超えると送受結果が
画面に表示できません。プログラムが暴走したような状態になってしまうんです。
データの型は倍精度浮動小数点なんですが、解決策は無いでしょうか？使用している
mpiは openmpiです。
0408デフォルトの名無しさん
2009/12/23(水) 10:52:260409デフォルトの名無しさん
2009/12/23(水) 12:40:54当初は配列をアロケートしていましたが、疑問に思い、配列を設定して
再コンパイルして実行しても同じなんですが。
0410デフォルトの名無しさん
2009/12/23(水) 13:05:15コンピュータに自分の意志を伝えるプログラミングができるわけがない。
ソースもなしに・・・エスパーも求もと書いとけ。
0411デフォルトの名無しさん
2009/12/27(日) 20:24:150412デフォルトの名無しさん
2009/12/28(月) 22:57:30プログラムは
program TEST
implicit real*8(a-h,o-z)
：
： MPIの使用開始の手続き
：
dimension a(2000),b(2000)
!
if(Nrank.eq.0) then
do i=1, 2000
a(i)=dble(i)
enddo
endif
!
call MPI_Scatter(a(1),20,MPI_DOUBLE_Precision,b(1),20,0,MPI_COMM_WORLD,ierr)
!
if(Nrank.gt.0) then
do i=1, 20
print *,Nrank,b(i) ：この部分で画面に出力
enddo
endif
!
iiii = 1 + Nrank*10
call MPI_Gather(b(1),10,MPI=DOUBLE_Precision,a(iiii),10,MPI_DOUBLE_Precision,0,MPI_COMM_WORLD,ierr)
:
として、実行したのですが、画面出力部分では、出力値が全てのランクで0.0となるんです。
当然のことながらGatherでも同様なんですが、どうやった良いのか原因も何も解りません。どうかご指導ください
0413デフォルトの名無しさん
2009/12/28(月) 23:06:52Scatterで...,b(1),20,の後にMPI_DOUBLE_Precision,を書き漏らしております。
質問時の記入ミスです。すみません。
0414デフォルトの名無しさん
2010/01/06(水) 09:09:27それとGatherの方で
MPI=DOUBLE_Precision の=が_の間違い。
a(iiii)は、ランク0に送るなら
ランク0の受信バッファーを指定するので多分a(1)です。
implicit real*8(a-h,o-z)
include'mpif.h'
dimension a(2000),b(2000)
call mpi_init(ierr)
call mpi_comm_rank(mpi_comm_world,Nrank,ierr)
if(Nrank.eq.0) then
do i=1, 2000
a(i)=dble(i)
enddo
endif
call MPI_Scatter(a(1),20,MPI_DOUBLE_Precision,
& b(1),20,MPI_DOUBLE_Precision,
& 0,MPI_COMM_WORLD,ierr)
if(Nrank.gt.0) then
do i=1, 20
print *,Nrank,b(i)
enddo
endif
call mpi_finalize(ierr)
end
0415デフォルトの名無しさん
2010/02/08(月) 17:39:36あるプロセスからの出力だけ途中で止まることがあります。
PCはintel fortran+mpich、大規模計算機はPGIfortran+Voltaire MPIです。
例えばプロセスごとにoutput00,output01,output02,output03のように
別のファイルに出力させているんですが、何かの拍子にいくつかが出力
されなくなったりします。ループの途中にbcastやbarrier等の同期があるので、
出力がないプロセスも計算そのものが停止しているということはないと思うのですが、
別のファイルや標準出力への出力も停止するのでうまく調べきれず、定かではありません。
かなり情報が少なくて申し訳ないのですが、考えうる原因、調査法、解決法もしくは
それに至らなくとも何か思いついたことでもあれば教えて頂けませんか？
0416デフォルトの名無しさん
2010/02/08(月) 19:42:12２桁のファイル名を決める整数が
違うプロセスで同じ整数になっちゃって・・・とか
とびとびになってしまって、とかは無いのかな？
PCとスパコンで違う並列数でやっておかしくなったのなら
同じ並列数（２とかｗ）でやってテストしてみては？
CPUが自分のプロセス番号（例題でよく変数名Myrankになるやつ)
を決める部分のチェックとかもやるといいかも。
とあるシステムでちゃんと動いてるので415さんのMPIの
(データ転送とかの)部分にミスがあるとは考えにくい、
という推定からすると他にはあまり思いつかないな。
0417デフォルトの名無しさん
2010/02/09(火) 00:30:15ノードローカルのディスクに書いてるとかいうオチならブチキレ
0418デフォルトの名無しさん
2010/02/09(火) 02:35:40少なくともジョブ終了後にユーザーがファイルを移動する操作を
する必要は無いような気もするけど・・・・
その可能性は大いにあるね。
0419デフォルトの名無しさん
2010/02/10(水) 18:08:04mpi_finalizeを実行せずに終了してるのでは？
0420デフォルトの名無しさん
2010/02/10(水) 20:33:470421デフォルトの名無しさん
2010/02/11(木) 10:58:34=> MPIとファイル出力はなんも関係ない
=> このスレとファイル出力はなんも関係ない
0422デフォルトの名無しさん
2010/02/11(木) 12:03:48MPI_Finalizeしなくても、ファイル出力していればファイルはできてるし、ジョブが死ぬときにファイルがクローズされるからそのときにフラッシュされるわけで
MPI_Finalizeしないことがファイルができないこととは無関係だっつってんだよ。
0423デフォルトの名無しさん
2010/02/11(木) 21:49:22次回以降のプログラムの実行がおかしくなることがあった希ガス。
確かlambootし直すと正しく実行できるようになったから、裏方のプロセスが
狂ったんだろうな。そういう状況ではファイル入出力が一部おかしくなっても
不思議ではない。
0424デフォルトの名無しさん
2010/02/11(木) 23:16:52途中でプロセスを頃したらmpichでもおかしくなることがあるが、あくまで通信に失敗すると言う次元のおかしくなり方だから。
0425デフォルトの名無しさん
2010/02/11(木) 23:37:48それによってプログラムの動き(例えば通信結果によってif文の判定を行っている)が変り、
ファイルへの書き出し部分を通過しなくなったというのは？
0426デフォルトの名無しさん
2010/02/12(金) 01:10:41つーか、その程度のミスならPCでマトモに動くとは思えないけど。
0427デフォルトの名無しさん
2010/02/12(金) 15:46:16一つのジョブで、MPI_Finalizeを指定しないで終了するプロセスがあると
通信がおかしくなることがあったと思う。
0428デフォルトの名無しさん
2010/02/13(土) 20:26:46ん？じゃぁ宛先はドコに置くん？
0429デフォルトの名無しさん
2010/02/13(土) 21:14:35メインプロセスがチャイルドプロセスを立ち上げる。
実装によるが、そのとき引数にチャイルドプロセスの情報を加える。
MPI_Initでargc, argvが要求されるのはそのため。
0430デフォルトの名無しさん
2010/02/19(金) 13:33:36N_local = N_global / numprocs;
double u_new[N_local + 2], u_old[N_local + 2];
こうやったら、Integer constant expression requiredって言われました
どうすればいいの？
0431デフォルトの名無しさん
2010/02/19(金) 19:29:59MPIの前にCの勉強をしろカス
といいたいところだが親切な俺様が教えてやろう
C89, C++では動的配列は使えない。
mallocかnewで確保汁！
0432デフォルトの名無しさん
2010/03/20(土) 18:01:31格子は150x150x150で、線形の拡散方程式です。
0433デフォルトの名無しさん
2010/03/24(水) 06:27:04・・・姫野ベンチって計算そのものはラプラスかポアッソンソルバーだったような気がする。
MPI版あったような・・・気がする。気がする、ばかりでなんだが。
それを元にして、というのも。
ライセンス的にアリなのかわからないけど理研(？)の人に聞いてみよう！
0434デフォルトの名無しさん
2010/03/24(水) 10:20:58データはどうなりますか？書き換えが必要ですか？
0435デフォルトの名無しさん
2010/03/24(水) 13:18:17Intel Fortran では要った、というか回避策を見つけ切れなかった。しょうがないので、
自分は#if つかってMPI通信部分を単精度用と倍精度用の２種類作って
そのうちの一つだけを使うように、#define 一行いじれば済むようににしたけど
・・・・忘れたｗときがイヤなのであまり満足していない。
プリプロセスもクレバーに使えばコンパイル時に
とあるオプションが使われたときにだけONになるように出来るハズだけど
使い方がいまいちわからんｗ
この部分はコンパイラのベンダ依存性もあるからあまり突き詰めても
しょうがないきがするので・・・・便乗だけど、賢者の人カモン！
0436デフォルトの名無しさん
2010/03/24(水) 21:28:25個数を配列の長さ*sizeof(TYPE)にして。
fortranでこんなことができるか知らんけど。
エンディアンがあってないと大変なことになるが気にしない。
0437４３５
2010/03/25(木) 03:25:12real r
r = 1.0
if sizeof(r) .eq. 8 then
call mpi_send(...,mpi_double,....)
else
call mpi_send(...,mpi_float,....)
endif
をつくってみたけど、コンパイル時のオプションで振舞がちゃんと変わった。
例では r は単精度か倍精度かの判定用のダミー、のつもり。
値が空だとなんか気持ちがわるいのでてきとうな値を放りこんでみた。意味はない。
0438434
2010/03/26(金) 17:48:06ありがとうございます！出来るんですね。
>>437
436さんの文章だけ見てもぱっと分かんなかったんで助かります。
試してみます。
もう一つ、mpich2って使ってる人いますか？
mpi_in_place使えるはずと思うんですが、mpi_reduceの中で使ったところ、
Invalid buffer pointerってエラーが出て使えません。
多分何かとんでもない勘違いしてそうなんですが、どこがおかしいでしょうか？
ちなみにこんな感じです↓
mpi_reduce(mpi_in_place,sumofv,n_cell,mpi_real,mpi_sum,0,mpi_comm_world,ierr)
0439436
2010/03/26(金) 19:38:08double a[N];
MPI_Send(... N, MPI_DOUBLE, ...)
の代わりに
MPI_Send(... N*sizeof(a[0]), MPI_BYTE ...)
なんだが。
これだとdoubleの代わりが単精度だろうが倍精度だろうが複素数だろうが構造体だろうが送れる。
>>437だと新しい型を増やす度に条件分岐が増える。
0440デフォルトの名無しさん
2010/03/27(土) 02:01:35なるほど！
0441デフォルトの名無しさん
2010/03/27(土) 12:13:43call mpi_reduce(mpi_in_place,sumofv,n_cell,mpi_real,mpi_sum,0,mpi_comm_world,ierr)
else
call mpi_reduce(sumofv,iwork,n_cell,mpi_real,mpi_sum,0,mpi_comm_world,ierr)
endif
0442デフォルトの名無しさん
2010/04/04(日) 09:08:14・・・宛先番号とか別に指定してるから、とある２つのプロセス間で２つ以上の通信が発生しなければ、
同じタグ番号でも困らないような気はするけど。
0443デフォルトの名無しさん
2010/04/14(水) 10:18:20インテルコンパイラを使うには、apt-getではなく、自らコンパイルしないといけないのでしょうか?
何か設定で切り替える方法があれば教えてください
0444デフォルトの名無しさん
2010/04/21(水) 01:33:13ここの通りにやってサンプルを使った
円周率の計算まではできたんですけど
自分で書いたC, C++を動かすことができません
とりあえずプロジェクトをいじってるんですがそれでいいんでしょうか？
何か留意点などありますか？
0445デフォルトの名無しさん
2010/04/21(水) 01:39:49mpi自体の設定もLinuxの方が簡単。
0446デフォルトの名無しさん
2010/04/21(水) 10:35:03並列クイックソートを実装しようとしているのですが、実行時にエラーが出てしまいます。
とりあえず2個のプロセッサでやってみてるのですが、いったいどこがいけないのでしょうか？
http://codepad.org/13tw3pKS
アドバイスお願いします。
0447デフォルトの名無しさん
2010/04/22(木) 00:58:42で、技術料はいくら払うんだ？
0448デフォルトの名無しさん
2010/04/30(金) 06:33:210449デフォルトの名無しさん
2010/05/10(月) 05:36:11それぞれの利点欠点を教えてください
0450デフォルトの名無しさん
2010/06/12(土) 19:14:06>nohup mpiexec -np 4 ./a.out >& log.txt &
標準出力(log.txt)に下記のようなメッセージが大量に書き込まれてしまいます。
これを表示させない方法はないでしょうか？
(handle_stdin_input 1067): stdin problem; if pgm is run in background, redirect from /dev/null
(handle_stdin_input 1068): e.g.: mpiexec -n 4 a.out < /dev/null &
0451デフォルトの名無しさん
2010/06/12(土) 23:35:54メッセージに書かれている通りのことをやればいいだけ
0452デフォルトの名無しさん
2010/06/13(日) 04:24:41ありがとうございました。確かに入力用にこれを指定すると出なくなりました。
しかし普通に入力ファイルをしていた場合は入力ファイルが読めずに、エラーが出たので、
このようにしたのですが、それはマルチノードの設定の問題でしょうか。
0453デフォルトの名無しさん
2010/06/13(日) 10:55:370454デフォルトの名無しさん
2010/06/16(水) 22:05:53プログラムを走らせて 使ってたのだが、速度が出ないので調べてみた。
殆どOn cacheで動くプログラム、キャッシュミスが無いようなプログラムなのに、
計算に使うコア数を減らすほど速くなる事に気がついた。3コアで最高速。
ふと、OCやめて定格に戻したら、まともな速度が出るようになった。
なんてこった。どうやらOCで逆に遅くなる事があるようだ。
OCする場合とOCしないときと速度比較してみる価値あるかもよ。
0455デフォルトの名無しさん
2010/06/16(水) 22:47:520456デフォルトの名無しさん
2010/06/16(水) 23:29:080457デフォルトの名無しさん
2010/06/17(木) 19:01:17通常のOCのリスク（熱・故障等）以外に、結果が狂うとかある？
0458デフォルトの名無しさん
2010/06/18(金) 00:53:44狂った事あるよ。
デカイファイルが出力されるプログラムを実行させてたときに
./a.out | gzip > out.txt.gz
とかやってたんだが、out.txt.gz をgzip -d で解凍させたら壊れて
ますとエラーが出たので気が付いた。OCでgzipがまともに動作し
なかった模様。多分計算結果も壊れてたんだろうな。
てかgzipで圧縮してなかったら計算結果が壊れてる事に気がついて
なかった罠。
0459デフォルトの名無しさん
2010/06/18(金) 01:00:23そろそろ１０月まで止めるかなぁ。電流計で測ると11A使っている
から1100Wの電熱器付けているようなもんだからなぁ。
0460名無しさん＠そうだ選挙に行こう
2010/07/10(土) 14:37:03台数を6台から１台に減らしたんだが、最適化に尽力したら、2倍速くなった(w
(一台あたりの話)
作業配列をunsignedからunsigned charにしただけで、1.2倍。
昔のCPUは1byteアクセスはペナルティ高かったような…
PentiumPro ぐらいの話だが。最近はペナルティ無いのか？
0461名無しさん＠そうだ選挙に行こう
2010/07/10(土) 19:12:52単純にはインテルコンパイラ使ってSSE吐いているならその部分は４倍速くなってるはず。
0462460
2010/07/10(土) 23:39:18単純にメモリ利用量が減ってキャッシュの効きがよくなっただけだと思います。
CPUがPhenom II 945だしインテルコンパイラーつかえねー
0463460
2010/07/12(月) 23:52:31コンパイラの最適化レベルを上げるとホットスポット内にある、めったに呼ばれない関数までinline展開されてループ内のマシン語が大きくなってしまう。
また、ifでの条件分離の確率をプログラマーが指定したくなるな。。これはコンパイラーの機能ではどうにもならなかったので、制御構造を変更するしかなかった。こういうのはコンパイラ変更したら無意味になりそうでいやーん。
マシン語がどういう形で展開されているかは、素直に読むとなかなか辛いので、以下のようにasm文で適当にＬＡＢＥＬ文を埋め込んでいけばいい。
---
asm(".HOGEHOGE_START:");
for(i=0; i < MAX; i++)｛ hogehoge;｝
asm(".HOGEHOGEEND:");
--
そして-save-tempsでマシン語をファイル(hoge.s)に出力させればいい。マシン語のC++の関数名は奇妙奇天烈な名前に変換されるが、c++filtで復元出来る。
$ cat tmp.c
void test(int hoge){}
$ g++ tmp.c -c
$ nm tmp.o
00000000 T _Z4testi <- 謎の関数名
U __gxx_personality_v0
$ nm tmp.o | c++filt
00000000 T test(int) <- 関数名を復元
U __gxx_personality_v0
0464デフォルトの名無しさん
2010/07/14(水) 03:12:44そんなこともあるんですか
あまり欲張らないでおこう
0465デフォルトの名無しさん
2010/07/14(水) 16:19:27MPIをインストールするのめどい。
やって欲しい事は、32coreのマシンと、数千個のファイルがある。
.a.outにこのファイルを一つづつ渡して実行してほしい。処理が終
わったら続いてファイルを渡して処理をして欲しい。同時に32個
のa.outを実行しつつ、処理が終わったa.outがあったら残りの
ファイルをa.outで処理してほしい。
0466デフォルトの名無しさん
2010/07/14(水) 16:24:100467デフォルトの名無しさん
2010/07/15(木) 00:26:56#pragma omp parallel for schedule(dynamic,1)
for( int i = 0 ; i < 1000 ; ++i ) {
char filename[100];
sprintf(filename, "file%03d.dat", i);
process(filename);
}
結構適当に書いたけど、こんな感じ？
0468デフォルトの名無しさん
2010/07/15(木) 22:00:42gccも４系はサポートしているみたいですので、試してみます。
0469デフォルトの名無しさん
2010/08/07(土) 11:07:24一見正しく動いていても、OCで遅くなったり計算間違ったり
ttp://hibari.2ch.net/test/read.cgi/tech/1099819556/454
ttp://hibari.2ch.net/test/read.cgi/tech/1099819556/458
0470デフォルトの名無しさん
2010/09/12(日) 06:01:26>>467 さんの schedule(dynamic,1)
は必須だね。これがなくてもちゃんと動くだろうけど、かなり能率は落ちるハズだ。
頑張ってね〜。
0471デフォルトの名無しさん
2010/10/03(日) 18:04:08MPICH2のmpdbootを失敗した際に出る(handle_mpd_output ***)のまとめサイトのようなものを探しております。
日本語か英語のサイトで見たことあるという方、教えていただければ嬉しいです。
0472デフォルトの名無しさん
2010/10/12(火) 03:47:24どれがdefineされているかを調べれば良いのでしょうか?
0473デフォルトの名無しさん
2010/10/22(金) 10:35:24apt-getでopenmpiをインストールした後、使用するコンパイラをgccからiccに変更する
方法がわかりません。
やり方を教えてください
0474デフォルトの名無しさん
2010/10/24(日) 02:32:25なるほど分からん
0475デフォルトの名無しさん
2010/10/24(日) 02:44:51定義済みマクロ
http://wikiwiki.jp/redstrange/?%C4%EA%B5%C1%BA%D1%A4%DF%A5%DE%A5%AF%A5%ED
__MPI
__OPENMP
0476デフォルトの名無しさん
2010/11/11(木) 06:38:52MPIの各ノードのコンパイラが違っても、コンパイラに依存したソースでなければ動作しますか？
よろしくお願いします。
0477デフォルトの名無しさん
2010/11/11(木) 10:15:27たとえば x86 なCPU で linux 上で、とかなら
.o ファイルかき集めて最後にリンクできて・・なら、
たぶんだけど意図したとおりに動くんじゃないかな？
コードはあげないけど中間ファイルならあげるよ、という人たちから
いろいろもらって一まとめで使う、とかなの？
0478デフォルトの名無しさん
2010/11/12(金) 14:02:34すみません質問がいい加減すぎました。
ノード１がCygwinでgcc_4.3.4を使っていて、
ノード２がUbuntuでgcc_4.4.4を使っています。
CPUはともにx86系です。
このようなときに、
MPIはコンパイラが異なることを気にせずにプログラムを動作させることができるかどうか知りたいです。
よろしくお願いします。
0479デフォルトの名無しさん
2010/11/12(金) 15:38:08まあ、動くかと。
gcc と intel は割と相性イイから
インテルも混ぜてあげよう
0480デフォルトの名無しさん
2010/11/15(月) 18:12:22のですが、どうすればよいでしょうか。
Windows版の場合には、mpiexec(のみ)が提供されていて、
mpiexec -env HOME <somewhere> -np ...
とすればできますが、
Linux版では、mpirunが提供されているが、mpirunには環境変数を指定する
オプションがないので、できなくて困っています。なお、インストールには
YaSTを使い、
mpich-1.2.7p1-214.3.i586
mpich-devel-1.2.7p1-214.3.i586
を入れました。
0481デフォルトの名無しさん
2011/01/13(木) 13:07:41bashrcに書けばいいんじゃない？
0482デフォルトの名無しさん
2011/01/26(水) 19:07:42Ａ×Ｂ＝Ｃで各プロセスがＡとＢのブロック行(ブロック行の行数は行列全体の行数/プロセス数)を保持している。
Ｂをプロセス間で循環させ、計算結果のＣを更新していくことでＡ×Ｂを計算せよ。
行列は正方行列で1024×1024とし、プロセス数は行数の約数とする。値は乱数で決める。
誰がやり方教えて下さい。プログラムの流れとかでも良いです。お願いします。
0483デフォルトの名無しさん
2011/02/09(水) 18:08:03000 333
111 444
222 555
rank0 rank1 rank2
step1
000 333 --- --- --- ---
--- --- 111 444 --- ---
--- --- --- --- 222 555
step2
000 --- --- --- --- 333
--- 444 111 --- --- ---
--- --- --- 555 222 ---
step3
000 --- --- 333 --- ---
--- --- 111 --- --- 444
--- 555 --- --- 222 ---
0484デフォルトの名無しさん
2011/05/21(土) 13:51:12.10Fatal error in PMPI_Barrier: Other MPI error, error stack:
PMPI_Barrier(476)..................: MPI_Barrier(MPI_COMM_WORLD) failed
MPIR_Barrier(82)...................:
MPIC_Sendrecv(161).................:
MPIC_Wait(405).....................:
MPIDI_CH3I_Progress(150)...........:
MPID_nem_mpich2_blocking_recv(1074):
MPID_nem_tcp_connpoll(1663)........: Communication error
とエラーが出てしまい実行出来ません。検索しても有効な解決策が見つかりませんでした。
どなたか解決策を教えていただけないでしょうか？
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