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Message Passing Interface (MPI) 統合スレ

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0001デフォルトの名無しさん

NGNG

MPIによる並列プログラミングについて話し合う統合スレッドです。

とりあえず本家
http://www-unix.mcs.anl.gov/mpi/

0002デフォルトの名無しさん

NGNG

MPIってなんだ?

http://www.h7.dion.ne.jp/~matsu/pc_cluster/mpi/intro/intro.html

0003デフォルトの名無しさん

NGNG

MPI(Message Passing Interface)での並列計算
http://p-grp.nucleng.kyoto-u.ac.jp/~uchida/mpi/

0004デフォルトの名無しさん

NGNG

CORBAとかでできないの？

0005デフォルトの名無しさん

NGNG

初心者ですが何かよい参考書はありませんか？

0006デフォルトの名無しさん

NGNG

http://slashdot.jp/articles/04/11/08/087207.shtml?topic=2

0007デフォルトの名無しさん

NGNG

>>6
高校生でもこれほどの環境を手に入れられる時代になったのですね。
素晴らしい。

0008デフォルトの名無しさん

NGNG

LAM/MPI Parallel Computing
http://www.lam-mpi.org/

SMPP > PCクラスタ超入門
http://mikilab.doshisha.ac.jp/dia/smpp/

｢スカラー･チューニング講習会｣｢並列プログラミング(MPI)講習会｣で配布したテキスト
http://accc.riken.jp/HPC/training/text.html

OOMPI
http://www.osl.iu.edu/research/oompi/

0009デフォルトの名無しさん

NGNG

0010デフォルトの名無しさん

NGNG

例とかが載っているサイトとかがあったら教えてください

0011デフォルトの名無しさん

NGNG

>>10
とりあえず9までにいくつかある

0012デフォルトの名無しさん

NGNG

MPIは使い方は簡単だけど、問題はアルゴリズムの並列化だよね。
MPI自体はほんとに難しいことはないから、リンク先でも読めばすぐにわかるよ。

0013デフォルトの名無しさん

NGNG

ＭＰＩ始めたばかりなんですが
mpiccを実行した後、mpirunすると
0 - MPI_SEND : Invalid rank 2
p0_23956: p4_error: : 8262
[0] Aborting program !
[0] Aborting program!
パイプ破壊
とエラーがでてしまいます。
何がいけないのでしょうか？；；

0014デフォルトの名無しさん

NGNG

>>13
他のMPIプログラムはちゃんと動いたの？
もし動いたのなら、今回動かなかったプログラムのソースは載せられる？

0015デフォルトの名無しさん

NGNG

>>13
> 0 - MPI_SEND : Invalid rank 2
Invalid rankなんだから、"2" に対応するpeがMPI_Sendで使用したコミュニケー
タに無いんじゃないの？

001613

NGNG

早速のレスありがとうございます
>>14
他のプログラム(πの計算）などはできました。
今回のは↓にＵＰしました。
http://www.geocities.jp/cirque55510/cellmpi.c

>>15
ちょっと

001713

NGNG

うわ・・書いてる途中で
>>15
知識が足りなくて理解できない…
本でも買って出直してきます；；

0018デフォルトの名無しさん

NGNG

>>16
for(source=1;source<mb;source++){
多分ここでしょ。でもmbをpに直しても間違いのような・・・
突っ込みどころたくさんあるんだけど、もうちょい勉強してみて。

0019デフォルトの名無しさん

NGNG

>>16
これでも読んでください。
同志社大学の人が授業で使っている講義資料かな？
あそこは設備があるしね。。
http://mikilab.doshisha.ac.jp/dia/smpp/cluster2000/PDF/chapter02.pdf

002013

NGNG

>>16,17
ありがとうございます。
周りに聞ける人いなくて助かりましたー
勉強してがんばります！

002113

NGNG

>>18,19でした…ミスばかりですみません；；

002213

NGNG

同志社の資料はわかりやすいですね。
「MPI並列プログラミング」（P.パチェコ著）も買ってみたんですが
結構難しくてちゃんと理解できるか不安に・・・。

0023デフォルトの名無しさん

NGNG

KNOPPIX クラスタ　情報交換会
日時：12月28日　13:30-
場所：同志社大学　京田辺校地　香知館　3F会議場
ttp://www.is.doshisha.ac.jp/SMPP/meetings/2004/041228.html

0024デフォルトの名無しさん

NGNG

む～んエラーばっかだ
かなり行き詰まってきた；；
<NO ERROR MESSAGE> : Internal MPI error! Attribute in commun
icator is not a valid attribute
Special bit pattern 0 in attribute is incorrect.
[0] Aborting program !
[0] Aborting program!

0025デフォルトの名無しさん

NGNG

プロセス数2以外でやると止まってしまうんですが
原因がわかりません…ご教授のほどを

他のプログラムはプロセス数に限らず動いたんだけどなぁ

0026デフォルトの名無しさん

NGNG

print文を入れてどこで止まってるか調べたら？
多分MPIの通信ルーチンの所だと思うけどね。

0027デフォルトの名無しさん

05/02/15 02:50:23

>>25
どういう状況でとまるのか書かないとわかりにくいッす。
愚考ながら、１のときと３のときでは止まる原因が違う、ということも。

ところで、MPICHのWIN版設定ってやってるページ少ないですね。
GUIのmpirunは接続異常は表示しないし…

0028デフォルトの名無しさん

05/02/18 03:07:35

ちょいとお尋ねしますが。
MPICHって、GlobalArrays実装してますか？
英文必死こいて読んで見たけど、らしき記述が見当たらないのです。
・・・いや、職場で異様に自信満々で「共有メモリ使える」と逝ってる香具師がいるもんで。
そもそも分散型プロセス通信の為の規格っつーか仕様ですよね？＞MPI

0029デフォルトの名無しさん

05/02/18 11:13:13

>>28
まさか「共有メモリ」なんて無いですよ。MPIって "Message Passing Interface" ですもん。
プロセッサ間のやりとりはすべてメッセージの送受信ですよ。

> ・・・いや、職場で異様に自信満々で「共有メモリ使える」と逝ってる香具師がいるもんで。
ずいぶんと不幸な職場環境ですね……

003028

05/02/18 21:09:43

>>29
・・・やっぱり？
おかしいとは思ったんですわ。
まあ、もうちょっと読み進めては見ますがせっかくだし。

それはそれとして、RMAのある実装って何かありますか？
MPICHにはないようで。
うまく使えばかなりおいしそうなんで、いじってみたい・・・

0031デフォルトの名無しさん

05/02/22 10:09:38

パソコンにインストールしたいのだけどどこから手をつけていいかわからん

0032デフォルトの名無しさん

05/02/24 03:22:52

とりあえず、
ハード的にはネットワークの使えるパソコン数台と、ルーター
ソフト系は上のほうの紹介サイトぐるっと回ってライブラリをとってくる。
あとはメインのプログラムの開発環境、これぐらい?

0033デフォルトの名無しさん

05/03/09 17:16:27

bcc32で使える？

0034デフォルトの名無しさん

2005/03/28(月) 08:43:19

拡張子が.cの場合は問題ないのに、.cppにすると下記のようなエラーが出ます。
何がいけないのでしょうか？解決方法を教えてください。
/tmp/ccGU5ztX.o(.eh_frame+0x11): undefined reference to `__gxx_personality_v0'
collect2: ld returned 1 exit status

0035デフォルトの名無しさん

2005/03/28(月) 08:45:49

拡張子を.cにする。

0036デフォルトの名無しさん

2005/03/28(月) 08:57:36

c++を使用したい場合は？

0037デフォルトの名無しさん

2005/03/28(月) 09:11:02

>>36
g++でコンパイルやリンクしてる？

0038デフォルトの名無しさん

2005/03/28(月) 09:12:40

mpiccです。

0039デフォルトの名無しさん

2005/03/28(月) 16:28:41

MPIつかったプログラムを走らせた場合、すべてのプロセスは終わるときも同時に終わるのですか？

0040デフォルトの名無しさん

2005/03/28(月) 16:30:00

同時に終わるようにプログラムしないと同時には終わらないよ

0041デフォルトの名無しさん

2005/03/29(火) 02:56:38

プログラム中で、クラスを作成し、プログラム終了時に、ブロックから抜けることによって破棄されます。
このクラスのデストラクタがランク0以外働かないのですが、何故なのでしょうか？

0042デフォルトの名無しさん

2005/03/29(火) 10:25:22

>38
mpiCCでいける

0043デフォルトの名無しさん

2005/03/29(火) 11:17:29

受け取る側のプロセスがまだrecv関数に到達していないときに、送信側がsendを送った場合、メッセージは破棄されてしまうのでしょうか？

0044デフォルトの名無しさん

2005/03/29(火) 11:53:30

>>43
まずはMPIの仕様書を読もうよ

0045デフォルトの名無しさん

2005/03/31(木) 07:23:49

MPIはC++には対応しているの？

0046デフォルトの名無しさん

2005/04/06(水) 14:28:48

G77などのフリーソフトでMPI関数で書かれたプログラム文を
コンパイルする詳しい方法分かりますか？

004746

2005/04/06(水) 14:40:00

OSはwindowsXPです。
include 'mpif.h'で定義ファイルを読み込むんですよね？

0048デフォルトの名無しさん

2005/04/06(水) 15:41:26

>>47
Unixは使えないのですか？

004946

2005/04/06(水) 16:07:03

>>48
使えないです。unixでないとできませんか？

0050デフォルトの名無しさん

2005/04/06(水) 16:30:58

G77ってgnuのfortran?

005146

2005/04/06(水) 16:33:04

そうです。無理ですか？

0052デフォルトの名無しさん

2005/04/06(水) 22:37:29

Windows上でのfortranコンパイラは何使ってるの？

005346

2005/04/06(水) 23:35:21

主にG77でコンパイルしています。

0054デフォルトの名無しさん

2005/04/07(木) 14:03:18

MPIを使ってPDEを解きたいのですが、データはそれぞれのノードがデータの一部分を持つのでしょうか？
threadを使ったプログラムは経験があるのですが、MPIでの作成方法がよくわかりません。

0055デフォルトの名無しさん

2005/04/11(月) 00:23:11

MPICH2使った人いる？MPICHは普通に動くのだけれどMIPCH2が全然機能してくれない。

0056デフォルトの名無しさん

2005/04/16(土) 01:49:10

mpichについていたπの計算するプログラムが理解できません。
なんでwhile(!done){}あたりのギミックが必要なの?

0057デフォルトの名無しさん

2005/04/16(土) 13:14:57

　　_、 _　∩
　(　∀`) 彡　>>56　教えてやってもいいが
((≡O　 ⊃
　 |　　 |　　　おまい！左腕を上下　右腕を前後
　し⌒J　　　同時にやってみろ！話はそれからだ！

0058デフォルトの名無しさん

2005/04/16(土) 13:52:56

CPUは別々に稼動してるだろ。CPU１個が処理終わったからといって
他のｎ個のCPUが処理が完全同期で終わる保証はどこにもないだろ。
だったら全部の処理が終わるまで待つのは当たり前だろ。
　それともそんなことすら解らないのか？プログラム組むの辞めろ。お前は
もう、日本から出て行け

0059デフォルトの名無しさん

2005/04/16(土) 16:24:45

>>56
> なんでwhile(!done){}あたりのギミックが必要なの?
単にコードの書き方がまずいだけと思われ。
この内容ならもっと見やすくシンプルにできるよね。

0060デフォルトの名無しさん

2005/04/16(土) 21:35:10

56です。
なんかわかったような気がする。
コメントアウトの部分のソースを無視していました。
頭悪くてすみませんでした。

>>58さん
MPI_Reduce()で全プロセスが終わるの待ってるのかと思ってたんですけど
違うんですか？

0061デフォルトの名無しさん

2005/04/30(土) 18:49:38

CPUが空いているマシンから優先的にジョブを割り当てるにはどうしたらよいのでしょうか？

0062デフォルトの名無しさん

2005/05/01(日) 01:56:36

エラーもなくコンパイルが終わり、プログラムを実行すると、ある時点で

p5_30033: p4_error: interrupt SIGSEGV: 11
Broken pipe
Broken pipe

というエラーが出ます。これは何がいけないのでしょうか？
個人的には、ファイルアクセスで問題が起きていると思っているのですが、エラーの原因が未だつかめません。

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