毎回プログラムにファイルサイズやらを書き換えていくのが面倒なので
>>528さんが言っているObjectOutput使って複数のファイルを一まとめにしてしまおうと思ったのですが
これは
１．纏めるファイル名をlist()か何かで配列に収める
２．手動で適当にファイル（txtとか）を作成して拡張子をjarしておく（binarry.jar
３．一つ目のファイルをbyte配列に読み込む
４．ObjectOutputでbyte配列を３のファイルに書き出す
てな感じで初めに作った配列分、３〜４を繰り返せばいいと思うのですが

ソースはこんな感じでいいのかな。。。
ObjectOutputてのが意味不明なので指摘お願いします…。

String[] files=new String[ファイル数]//ファイル数
for(i=0; i<files.length; i++){
...
...//目的のファイルを読み込む部分
...
byte[] b;//書き込むデータのbyte配列
conn = (StorageConnection) Connector.open("file://mc/binarry.jar");
os = sc.openOutputStream();
ObjectOutput out = new ObjectOutputStream(new FileOutStream(os));//この辺りから意味不明
out.writeObject(data, b);
out.frush();
out.close();
os.close();
conn.close();
}