うちのWin2000の場合、最小化するとその時点で優先的にスワップされる
ので、長時間最小化したままだと他のアプリにメモリを取られて、
アクティブにしたときに使用メモリをすべて(５０MB以上）再読み込みするので
反応が遅くなる。ので、一度立ち上げたら最小化しないようにしてる。
最小化しなければ、フォーカスを切り替えても使用メモリをスワップされない。

話題になってるのはこの現象のこと？だったら、Eclipseじゃなくても
メモリをガバガバ確保するアプリすべてに起こる現象だよ。