みなさんレスどうもです。
やはりファイルシステムは処理系依存だから標準では
どうにもならんですか。素直にＡＰＩとか使うしかないですね。
ちなみに
system("mkdir");
system("cls");
で、もしディレクトリ既存のエラーがでても一瞬出てすぐ消せますね（ｗ。

余談ですが、C++のBoostにfilesystemってのがあるようですが、あれだと
チェックができてなおかつ移植性があったりするんですかね・・・。