>>693
漏れも unix コマンド的に使う java アプリを作ったときその辺困ったけど、
標準入力を受け取るコマンドってたいていファイル指定もできるもんじゃない。
だから、ファイル指定があったらそのファイルを System.setOut() するようにしちゃって、
Eclipse の起動オプションでファイル名を指定するようにしたよ。
で、標準入力からのテストはコマンドラインでやりますた。