メッセージループについてなんですが、

時間のかかる処理をしている最中にも、
ウィンドウ操作ができるようにと、
PeekMessageを定期的に呼び出すようにしたのですが、
その時に、メニューとかの操作を行うとその処理が終わるまで、
呼び出し元（＝ここでは「時間のかかる処理」）が止まってしまいます。

呼び出し元を止めずに処理することはPeekMessageでは出来ないのでしょうか？