メニューバーやツールバー、ポップアップメニューの項目が増えて困る、というのは、
専用のパースペクティブを定義することで解決してます。
メニューから「ウィンドウ」→「パースペクティブの別名保管」で、
現在表示中のパースペクティブを好きな名前で保存できますよ。

ウチの環境だと、VisualEditor用とかOmondo用とかのパースペクティブを、
Javaパースペクティブをベースにして定義して使ってます。
VE用だと、ポップアップの「新規」にVisual Vlassの項目があったり、
編集画面を広めに取った分パッケージ・エクスプローラが高速ビューに引っ込んでたり。

編集する内容によって、大きくしたいビューとどうでもいいビューが決まってくるので、
狭い画面を有効に使う為に専用パースペクティブを定義するというのもありです。
その都度ビューのサイズを変更してもいいですが、面倒ですから。