さっき手動で設定したフォームのTopMostは解除(false)しておく。

ツールバーの続き。
ツールバーをダブルクリックする。コードをコピペ。

if (e.Button == this.toolBarButton1)
{
  this.TopMost = this.toolBarButton1.Pushed;
}

これでツールバーによる制御ができるはず。
どうですか?