漏れも最近MinGW相手にクロスコンパイラ編成しますた。
ぶっちゃけ、イバラの道ですた。
Cygwinと比べてコミュニティの規模が小さいせいか、自前で解決しなきゃ
ならんネタが多いんですよ。
MinGWのダウンロードページから落とせるtar玉には大抵MinGW用のパッチが
あたってるので、迂闊にGNUのページとかから落としてくるより楽なんだけど、
それでもビルドできないシチュとかが結構ある。
特にクロスコンパイル編成だと、configureが混乱するのか、時々わけのわからん
ヘッダを持ってこようとしたりして、激しく混乱が加速するです。
ビルド済みパッケージには、大抵ポーティングリスト（元のパッケージから
何を変えたか）が添付されてるので、使わなくても落としてくるのが吉。
/usr/doc以下にドキュメント追加されます。
gdbがシリアル接続受け付けなかったり、明らかに消しちゃいかん機能を
消して無理矢理ビルド通してたりするので、いまいち信用ならないけど。

漏れ的に困ったのは、gccがfork等posixの関数を要求してくるところとか。
collect2とかが引っかかるので、Makefileから外してしまうので一応解決するます。