それでもいいんですけど、やっぱ、レジストリは
変更されてしまうんですかね。

たとえば、ドライバ立ち上げ → 青画面即死 → OS再起動、
という手順を踏んだとき、レジストリには前のドライバの残滓が残っていそうで、
それがいやなんですよね。
とにかく、レジストリってトラブルの巣窟（２ｃｈではスクツですか？）なんで、
極力いじりたくないんですよ。