間違えた!!こっちが正しいです。
さっきのは参照できますね。
class
{
 public 構造体[,] 配列;
 public struct 構造体
 {
  public float x,y;
 }
 メソッド()
 {
   float x、y;
   配列 = new 構造体[n1,n2];
   for(int i=0;i<n1;i++,x+=10)
   {
      for(int j=0;j<n2;j++,y+=10)
      {
        配列[i,j] = new 構造体();
        配列[i,j].x = (float)x;
        配列[i,j].y = (float)y;
      }
   }
 }

 別のメソッド
 {
 float a;
 a = 配列[i,j].x //ここでは参照できない!!!
 }
}