ひがさん主導のS2JSFに出てくるMayaと、まさたかさん主導のMayaはまったくの別物みたいですよ。
IPAに採択されたのは後者のMayaのみ。日記漁ると昔いろいろあったようで、名前が同じなので判りにくいですけど。

S2JSFはデザイナとの分離はできてないと思います。理由はビューにおもいっきし専用タグが出現しまくるからです。
一方、後者のMayaは、デザイナとの分離は出来てます。
デザイナに画面発注してプログラムが入る余地があるところは、idを付けて貰えばそれに引っ掛けて動的なコンテンツを
注入できる。やろうと思えばid=""なくても、XPathで好きな位置に注入もできるみたいですし。
つまり既にあるHTMLに対してそのファイルは編集せずに.mayaファイルによる後付で動的なページにできるってこと。
なので、デザイナとの分離が出来てると言えます。実際Maya使ってみるとかなり良いですよ。

Mayaはあくまでテンプレートエンジンであって、MayaはStruts・WebWork・Springなどたいていのフレームワークと
一緒に動かすことが出来て、将来的にS2JSFのビューになる作業も最近進めているみたいです。
そうなれば、S2JSFのビューもデザイナとの分離が出来ていると言えるようになるかもしれません。
S2Struts + Mayaってのは、Struts(MVCフレームワーク) + S2Struts(DIコンテナ橋渡し+α) + Maya(テンプレート)
という3つを組み合わせたものですよね。S2Strutsの+αは、無設定Strutsとか。

また、Mayaの公式サンプルを見てみると、単体でもMVCフレームワークっぽい動きをJavaScriptで出来るので、
Strutsなどがなくてもそれっぽいことできるみたいです。

JSFはMyFacesで考えると動きが微妙なので好きになれないです。S2JSF1.0.0で作って動かしてるシステムが
あるものの改修するのが面倒なので、Maya + S2Struts(無設定Struts)あたりで作り直したいと思っています。
JSFはもっと作りやすくなるまで当分やりたくないです。なんでJSFの話が最近多いのか疑問。。。流行？

Seasar関連はドキュメントが十分に整備されていないのが残念ですが、もの自体はどれも良いですよ。
あとベータっぽいイメージがあるので提案しにくいってのもあるでしょうけど。
不思議なことに海外製だと実際ベータのものでもベータに見られないようで、すんなり通るのに・・・。