>>272
ありがとうございます、やってみました。
using namespace std;　を消すと　GHMM_Sequence undeclared　と出たので、
ライブラリのヘッダファイルを見たら、クラスらは　namespace std { }　で囲われて宣言されてました。
なので　using namespace std;　はどうやら必要なようです。

GHMMユーザーが少ないのが痛いですねー。
Google日本語11件て(；・∀・)　　英語で探してもいいページないし
う〜〜〜ん・・・