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1.フォルダAとフォルダBがある。
  (フォルダAには拡張子vbsのファイルが、フォルダBには拡張子txtのファイルが入っている)
2.フォルダAからファイルをひとつ取り出す
3.フォルダBから拡張子を除いた部分の名前が同じファイルを探す
4.フォルダAとフォルダBのファイルの更新日時を比較して、
  フォルダAのファイルが古ければテキストファイルにエラーを出力。
5.フォルダAのファイルが無くなるまで2〜4を繰り返す

こういうフローでいいならできる。