>>664
>曲を変えるたびにIGraphBuilderをReleaseして
>CoCreateInstanceし直さないと駄目なんでしょうか？

そのようです。もしくはフィルタを全て削除する。
CoCreateInstance したくなくて、常に同じフォーマットのメディアを再生するなら、
ソースフィルタだけを繋ぎかえることでいけると思います。
詳しくはドキュメントを読んでください。

>CoInitialize(NULL)を毎回行わないと失敗してしまいます。

そんなことは無いはず。どこか他にミスがあるのでは？
例えば、解放処理部分で CoUnInitialize を呼んでいるとか。

>これを毎回呼んでも問題ないのでしょうか？

問題ありませんが、CoUnInitialize を同じだけ呼ばなくてはいけません。

通常、アプリケーション(スレッド)の初期化部分で CoInitialize を、
終了部分で CoUnInitialize を呼びます。