質問です。

現在OSはWIndows98SEで、AcrivePerl5.8　をインストールして
Perlが正常に動作いたしました。
ところがopen関数で外部ファイルを読み込もうとすると失敗してしまいます。
具体的な例だと、

$pepfile = 'proteinseq.log';
open(PROTEINFILE,$pepfile);
$protein = <PROTEINFILE>;
print "$protein\n";

をMS-DOSで実行すると

readline() on closed filehandle PROTEINFILE at script/4-5.pl line 11.

となってしまいます。
ファイル名は間違っていません。
なぜ開けないのでしょうか？
ちなみに、これにＨＴＭＬのヘッダーをつけてＣＧＩとしてブラウザで実行すると
proteinseq.logをちゃんと読み込んでくれました。