QueryPerformanceCounterと
QueryPerformanceFrequencyは使わない方がいいよ。
RDTSC呼ぶから偶に数百ミリ秒止まったりする。

timeGetTimeで我慢するか
RDTSCでウェイトかかるCPUとRDTSCが元々使えないCPUをきちんと排除してから
QueryPerformanceCounterを使いなさい。