>>763
プリコンパイルヘッダは、コンパイルの高速化のために
コンパイルの途中結果をファイル化しておくもの。
ソースの一部変更などであればそのまま使えるが
ヘッダやソースの大幅変更した場合は破棄されて
再び作成される。
リビルドすれば、まっさらな状態からコンパイルできる。

もしかしたら、プロジェクトの作成方法がおかしいかもしれないので、
プロジェクトだけ別名で作成して、既に打ち込んだソースは別のところに
バックアップして、新しいプロジェクトのソースに貼り付けて見るといいかも。