CWinApp::InitInstance()のオーバーライドのソースに
#include <iostream>を入れると、

>error LNK2005: "void __cdecl operator delete(void *)" はすでに
>libcpmtd.lib(delop.obj) で定義されています
>fatal error LNK1169: 1 つ以上の複数回定義されているｼﾝﾎﾞﾙが見つかりました
>link.exe の実行ｴﾗｰ

というエラーがでまつ。
MSDNでは、マルチスレッド対応してないライブラリが混ざってると。
MFCって本当にC++でつか？