暗号化の基礎の基礎といえばこれか。
public class Rot13{
　public static void main(String[] args){
　　byte[] rot = args[0].getBytes();
　　　// 暗号化
　　　for(int i = 0; i < rot.length; i++){
　　　　rot[i] += 0x13;
　　　}
　　　System.out.println(new String(rot));

　　　// 復号化
　　　for(int i = 0; i < rot.length; i++){
　　　　rot[i] -= 0x13;
　　　}
　　　System.out.println(new String(rot));
　　}
　}
}
実行結果
% java Rot13 hogeほげ
{?x菩陛
hogeほげ