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1の中間フォーマットって何？
XMLってのはもう決まってんだから、適当にタグ付けして、
あとは実際の運用で決めていくしかないと思うけど。

4はGUIの事いってんの？
フィルターなら一括処理できなきゃ意味が無い。
1が作った様な糞なGUIだったら不用。
DLLかコマンドラインツールで十分。

さっさと2を作っちまってください。