日本人のルーツについては、NHKの「日本人はるかな旅」って番組でDNA調査までやってるよ。
http://store.yahoo.co.jp/iimono/93533-0000001.html

＞1・マンモスハンター、シベリアからの旅立ち
＞日本列島に根付き、豊かな文化を築き上げてきた縄文人に関する意外な事実が分かった。
＞南方アジアがルーツと見られてきた彼らのDNAを調査した結果、シベリアに住むブリヤート人と遺伝的に血縁である可能性が浮かび上がる。
＞氷河期、日本列島を渡ったマンモスハンターたちの生き様を追う。

とりあえず縄文人は朝鮮半島よりシベリア方面から来たらしい。
中国や朝鮮からの移民が来たのは縄文時代末期だと。