調べててみると...

ttp://web.kyoto-inet.or.jp/people/pessi/PC9800HOWTO-16.htmlより

容量 セクタサイズ セクタ数 ヘッド数 トラック(シリンダ)数
(1) 1232KB(1.2MB) 1024バイト 8 2 77
(2) 1440KB(1.44MB) 512バイト 18 2 80
(3) 1200KB(1.2MB) 512バイト 15 2 80
(4) 640KB 512バイト 8 2 80
(5) 720KB 512バイト 9 2 80

これらのフォーマット形式のFDに、セクタ、ヘッド、トラックを指定して
書き込み、読み込みをしなければならないということですね。
セクタ、ヘッド、トラックを指定して書き込みが出来るソフトを探してきます。