あなたの言う通りでした
申し訳ありませんでした

open(FILEHANDLENAME, ">>filename") || die "Can not open file for output:$!";

binmode(FILEHANDLENAME); # if you output binary data

print FILEHANDLENAME "hogehoge";

close(FILEHANDLENAME);

こうすればいいんですね
あってますか？