実際、機械語はどのようになっているんですか？
思うに、XXX.exeが作成されるとAPIコールするという
命令？が羅列されているのでしょうか？
また、DLLを参照するようなプログラムはDLL参照命令があると想像します
ちなみにネイティブコードとはCPUに依存するというよりOSに依存するという意味で正しいですよね？