Windows Server 2003 RTM を MSDN から落として入れてみたんだけど
.NET 1.1 （だけ）が入っているのはいいとして、 1.1.4336 がはいっていたよ。

1.0 で作ったアプリも別途 1.0 の RunTime 入れなくても動くんだね。