とりあえず話整理すると、

EJB3によってPOJOでの開発が可能になった。生産性はDIコンテナと同等レベル
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分散オブジェクトが気に入らなければローカルEJBで作ればよろし
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J2EE標準、血統書付き
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EJB3マンセー?

懸念点
1、DIの設定はソースコードの中ではなく外(例えばXMLファイル等)に在るべきという意見。
2、EJBコンテナへの依存。これは分散オブジェクトをサポートする以上仕方ない?

って所でOK?
EJBのAnnotation APIと互換性のあるDIコンテナとか在ったら面白いかもね