uintで済むものにわざわざlongを使うメリットが思い浮かばん
ループの添え字にushortじゃなくintってのなら分かるがな

unsignedが廃止されるなんてどこにも根拠がないし
強いて言うとJavaに移植しやすいくらいか

デメリットはあるが
1. メモリが無駄（特に配列）
2. 遅くなる（少なくともIA32では）

64bitに移行すれば後者はushortと同じく相殺されるが
メモリが無駄なのは相変わらず