確かプロジェクトの設定のC++ファイルとして認識する拡張子あたりに
cpp;cxx;...とか書かれてるはずだからそれに.tmplを追加すればいいと思う
その後、プロジェクトに該当ファイルを追加して、
そのファイルの設定のビルドから除外をはいに設定すれば目的は達成されるはず