アプリケーションの互換性に関しては、「現在Win32アプリケーションを持っているのなら、
セキュリティの問題などがなければ、それはLonghornでそのまま動作する」
「すでに.NET Frameworkを使っているのなら、それはLonghornで動作するし、
WinFX APIへの道にいる」（オルチン氏）としている。
http://www.atmarkit.co.jp/fwin2k/insiderseye/20031114pdc03-03/pdc03-03_02.html

ビルド済みのexeはLHで動作する.NETFW1.1のランタイムがあれば動くだろ。