ＪＡＶＡアプリケーションをコマンドプロンプトから実行
しているのですが、普通のWindowsプログラムみたいに
コマンドプロンプトから独立して動かすにはどうしたら
いいですか？

動かしている間、コマンドプロンプトが使えないのよ。