>>626
Webアプリのクラスローダに乗ってるなら、
Webアプリだけ再起動なり再配備なりすればいいんじゃないの？

情報は、アプリサーバの公開マニュアル探せば？
http://publib.boulder.ibm.com/infocenter/wasinfo/v6r0/index.jsp?topic=/com.ibm.websphere.base.doc/info/aes/ae/twbs_configwbsdd.html
http://www.beasys.co.jp/e-docs/wls/docs91/webserv/jsr109.html#1039234