複数人で作業してる場合に、誰かが勝手にファイル名を変更したら
他の人が困るからね。
逆に言うと、一人でやってるなら、
・リポジトリ内のファイル
・作業ディレクトリ内のファイル
・作業ディレクトリ/CVS/Entries に記されているファイル名
をすべて変更してやれば、とくに問題なく名前変更できる。