>>109
手っ取り早いのは vpath でサーチするディレクトリを追加じゃない？
bin に ふつーに Makefile を書いて vpath で include や src を追加したら
それらのディレクトリも見てくれる。
厳密にやりたいなら、スクリプトの助けがいりそう。
おいらは素人なので偉い人ならもっとスマートにできるかもしれないけど。