>439 じゃ何らかのBufferedReader bfは作ったとして。
import java.util.StringTokenizer;

・・・
boolean isDataHeaderFound;
int line,counter;
int dataList[] = new int[MAX];
String tmp = new String();
StringTokneizer st;
while(!(s = bf.readLine(line)) = null){
  st = new StringTokenizer(s);
  if(!isDataHeaderFound){
   if((st.nextToken()).equals("SampleB")){//文字列の比較は等号を用いない
    isDataHeaderFound = true;counter = line+1;
   }
  } else {
dataList[line-counter] = Integer.parseInt(st.nextToken());
   //Integerクラスのstaticメソッド、parseIntを呼び出している。
}
}
・・・
line++;
}