>>793 pro以上を持ってるなら Forms.pas の

procedure TCustomForm.WMSysCommand(var Message: TWMSysCommand);

を参照
　つまり最小化=SC_MINIMIZEが送られた来た時に
　 　Application.MainForm が自分なら、 Application の最小化を行っています

この動作を迂回すればよいでしょう。迂回方法はお好きな方法で