コンボボックス自体の高さ（展開時の高さではない）って変えられないのでしょうか？

これでは変わらない↓
SetWindowPos( hCombo, NULL, 0, 0, x, y, SWP_NOMOVE | SWP_NOOWNERZORDER );

エディットコントロール（ID=1001）の高さ変えてもだめですた．．．