(Web)アプリケーション鯖って使ったことないんだけど、要するに
・HTTPが喋れる
・なんらかの言語が走る(Javaとか)
ってことでいいの？

Apache+CGI(Perlなど)よりもパフォーマンスが優れている以外に
メリットあるの？　今のところApache+CGIで困ってないし…。