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えっと全部のチェックボックスをチェックするのかな？よく分からないけれど、
それならこんな感じ。
<script>
var targets = external.menuArguments.document.all.tags("input");
for(i=0;i<targets.length;i++){
if(targets[i].type == "checkbox"){
targets[i].checked = "true";
}
}
</script>
を適当なフォルダにallcheck.htmlとして保存。
レジストリエディタでHKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Internet Explorer\MenuExt
を開いてallcheckっていうキーを追加、allcheckの標準の値を保存したallcheck.htmlのパスに設定。
更にcontextsっていう名前でDWORDの値を作って1に設定。
で、IEを立ち上げなおせば、右クリックメニューにallcheckが出てくるはず。