ベンチマーク見つけたよ。
http://www.javalobby.org/fr/html/frm/javalobby/features/jpr/part3.html

真ん中の方のグラフを見ると、SunのJVMよりもCLRのほうが全体的に速い
らしい。でも、IBMのJVMと比べると, 負けてる部分もあると。