スレッドを保有しているノード毎に一意になるIDを割り振れ
ばいいんじゃない？URLみたいなイメージで。

たとえば、ニュース速報っていうカテゴリにいくつかスレッドが
あったとした場合でも、

ニュース速報/hogehoge/P2P掲示板ついに公開(122)
ニュース速報/pagepage/P2P掲示板でﾀｲｰﾎ(26)

みたいな感じ。hogehogeとかpagepageとかが、実際のノード識別
IDになる。で、ニュース速報の全スレッドっていうように指定して
しまうと、全てのスレッドが表示されちゃうけど、どうもpagepage
ノードの内容は意味不明でダメだってなったら、hogehogeノードの
スレッドだけを表示するようにすればいいと思う。
こうすれば、きちんと管理されていて、常時稼動していそうなノード
の情報以外は自然に淘汰されてきて、良質な親ノードだけが残るような
気がする。

ここら辺は、実際のwebの掲示板と同じで、きちんと運営されている
webの掲示板にはいろいろ書き込みされるけど、管理されているんだか
されていないんだかわからない掲示板には誰も書き込みしないのと同じ。

あと、ちなみに言うと、ノード毎に一意になるIDを割り振っても匿名性
は問題無く確保できる。