とりあえず2ch風味の番号制度はやめたほうがいいな。
メールのヘッダみたいに、発言単位にユニークなIDをふって、
ツリー型掲示板のように実装をしていけば、情報が欠けても話題がわからなくなることはなくなる。
(ただし、何か情報を持っている人は、常に親の情報を持っていることを制約事項とするわけだけど)

俺はサーバの観点からP2P掲示板を考えてみることにしますわ。
何か面白いアイデアが出来たらどこかで披露します。