Pointクラスをベクトルとして扱ったら…他のメソッドはどうなるでしょうか。
演算メソッド。
　Point add(Point anotherPoint);
　Point subtract(Point anotherPoint);
　Point dotProduct(Point anotherPoint);
　Point crossProduct(Point anotherPoint);
こんなところかな。
こうしておけば、>>350みたいにわざわざ座標を取り出して
外部で+1して、また戻すことをしなくてすむ。
　aPoint.add(Point.XY(1, 0));
でいいもん。
これに違和感があるなら、平衡移動を表わす translate を付け加えても良い。
　aPoint.translate(1, 0);
状態変化がおこるなら、なるべくPointクラス内部でおこしたほうが良い。
(ちなみに、僕的には、x, yに直接setするセッターは要らないと考えます。
直接setする値が分かってるなら、新しくオブジェクトを生成すべき。)

それでも、Windowの座標(おそらく、Windowの左上と右下の座標)を表わすのに、
こんなPointクラスは要らないって？
僕は、結構有用だと思うよ。
2点間距離を求めるのは、aPoint.subtract(anotherPoint).getR();でいいしね。
極座標は要らない？あった方が便利だよ。
例えば、Windowsのタスクバーで右クリックの重ねて表示をやってみて。
Windowが-45°で重なって表示されたでしょ？
これが、顧客の要望で距離30角度-30°で重ねて表示にしてと言われたときに、
defPoint = Point.RT(30, -30) のPointオブジェクトを用意しとけば、
1つ目のWindowの左上座標 aPoint から考えて、
aPoint.add(defPoint) が2つ目のWindowの左上座標って求まるでしょ？
これを外部で計算すると、sinやcosが見えてなんかスマートじゃなくなるのよね。