それはIdleプロセスのCPU使用率だ。
Idleプロセスは、優先度が低くてCPUが暇なときにチョビット呼ばれて
暇つぶしにバックグラウンドプロセスをInvokeする、暇河童使いだ。

暇河童使いは他のプロセスがCPUを使ってる間はほとんど動かない。
寝てる。
暇なんだよ。

暇河童使いのCPU使用率が0.0003くらいということはだな、
お前の糞プログラムか他のなにかがCPUを99.9997%くらい使用してるってことなんだよ。

CPUごとの空き率をしりたければ 100 - % Processor Time - % Priviledged Time - % User Time
を計算しろ。

で、パフォーマンスを計るプログラム作ってるなら、せめてビジーループだけは組むな。