>個人的な意見はJ2EEでやっていきたいけど.NETはサンデープログラマ程度に
学んでおきたい。

技術者として稼いでいきたいのであれば、
仕事ではJavaとC/C++（経歴にも有利）、
将来性を考えてこっそり.NETも押さえとく、
というのが一番無難なところではないかな？

.NETはまだリリースすらされていないので、
この時期で一蓮托生を決め込むには早い。