俺、EJB知らないんだけど、高々数十人から数百人がユーザのシステムには
おおげさ過ぎない？
いや、俺が無知だってのは知ってるから煽らないでね。

Javaでやりたいなら、
Apache+Tomcat+JSP+Servletで十分だと思うんだけど。
でも、
Apache+PHP+Any RDBMS
ってほうが作りやすい気がする。