俺はWindowsプログラマだ。組み込みは知らん。
あと、普通Cコンパイラはインラインアセンブラが使えるから、
全部control可能だ。

http://www.amazon.co.jp/exec/obidos/ASIN/4894710803/ref=sr_aps_d_1_3/250-4681803-4271445
この本読めばJavaNativeInterfaceへのアクセス方法わかるのか？
わかるんなら取り寄せて読んでみるけど。

VMを書くのに、お勧めの書籍があったら教えてよ。