ふっと思ったのだが、
それより、更新対象行を特定するのに
インデックスは使っているのか？

パフォーマンスにおける
インデックス作成と更新処理は
相反するものだが、
おれは、インデックス更新より、
更新対象行を特定するのに、
テーブルスキャンする方がオー
バヘッドが高いと思う。

更新処理のクエリプランを調査し、
更新対象行の特定にきちんとインデックスが
使われているか確認すべし。